Génomique : fondements et applications

Code UE : US410S

  • Cours
  • 6 crédits

Responsable national

Antonia SUAU PERNET

Responsable opérationnel

Antonia SUAU PERNET

Public et conditions d'accès

UE accessible seulement aux élèves de la licence professionnelle de génomique

Objectifs pédagogiques

Connaissance approfondie des concepts et des outils de génomique

Compétences visées

compréhension et applications de la génomique

Contenu

Génomique, structures des génomes, des gènes, bases d'épigénétique, enzymes de chirurgie des génomes, oncologie, thérapie génique, qPCR, animaux transgéniques (knock-in, knock-out), ChIP, ChIP-seq
Génomique structurale
  • Structure des gènes procaryotes et eucaryotes, Familles de gènes, Pseudogènes
  • Organisation des génomes procaryotes et eucaryotes
  • Marqueurs géniques : STS, microsatellites, SNPs, ...Cartographie génétique et physique
  • Séquençage à haut débit : pyroséquençage, Roche 454, Illumina, ion Torrent, Nanopore ...
  • Localisation de gènes et de séquences régulatrices
         - DNase HS (Hypersensibilté à la Dnase) ...
         - ChIP (Chromatin Immuno Precipitation), ChIP on chip, ChIP-Seq
  • Génotypage de SNPs, détection de mutations, analyse des méthylations de l'ADN
           criblage par dHPLC, HRM, SNP arrays, etc  ...
  • Cytogénétique moléculaire   Fish, Prins,  CGH array
Génomique fonctionnelle
  • Expression transcriptionnelle / Analyse individuelle
         
    Dot blot, Northern blot, RPA = RNase Protection Assay, RT-PCR, q-RT-PCR
  • Expression transcriptionnelle / Analyse globale
          Microarrays, SAGE, Digital Gene Expression, RNA-Seq
  • Expression traductionnelle / Analyse individuelle Western blot, Immunoprécipitation
  • Expression traductionnelle / Analyse globale (analyse du protéome)
    Electrophorèse bidimensionnelle, Spectromètrie de masse, Puces à protéines
  • Inactivation ciblée d'un gène
    Recombinaison homologue, Knock out, Knock in, RNA interference par siRNA et shRNA
    Élimination conditionnelle de gènes et remplacement de gènes : Cre/loxP ...
    Promoteurs inductibles artificiels : Tet On, Tet Off
  • Modification ciblées du génome
    méganucléases, zinc finger nucleases, Cre Lox modifié, TALENs nucléases, CRISPR-Cas9
  • Études d'interactions : Criblage par Double hybride, Simple hybride, Analyse par Affinity pull down, Biacore ...
Maladies génétiques Clonage positionnel, génétique inverse
L'ADN médicament 
Thérapie génique - Vaccins à ADN
Focus technologique
  • Puces à ADN : principes, méthodologies, technologies, applications
  • Séquençages NGS
  • Aptamères, synthèse par méthode Selex
  • Diffusion des technologies de la génomique en diagnostic
Technologies récentes et émergentes
  • Assemblages de " biobriques ", biologie synthétique.
  • PCR microfluidique à haut débit haut débit, PCR sur cellule unique
  • Nanostring, Western Blot microfluidique
Concepts émergents
  • RNomique,
  • Métagénomique
Épigénétique : Notions de base
Virologie : Notions de base
Oncologie :Notions de base
 

Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants

Chargement du résultat...
Patientez
Type
Intitulé
Equipe pédagogique
Modalité(s) / Lieu(x)
Code
Modalité(s) / Lieu(x)
  • - Enseignée en formation présentielle et/ou partiellement à distance : Paris
  • Type Intitulé Equipe pédagogique Modalité(s) / Lieu(x) Code

    Contact

    Equipe pédagogique Agroalimentaire, Biotechnologies, Chimie
    307, 35-4-40, 2 rue Conté
    Paris 75003
    Antonia Suau-Pernet

    Voir les dates et horaires, les lieux d'enseignement et les modes d'inscription sur les sites internet des centres régionaux qui proposent cette formation

    Enseignement non programmé en 2017/2018