Outils mathématiques et informatiques pour la génomique

Code UE : BNF203

Cours
6 crédits
Volume horaire de référence
(+ ou - 10%) : 50 heures

Responsable(s)

Jean-Francois ZAGURY

Josselin NOIREL

Public, conditions d’accès et prérequis

UE d'informatique, de statistiques, et BNF104 du diplôme d'ingénieur de bio-informatique
Public de niveau Master

Objectifs pédagogiques

Connaitre les données, les outils algorithmiques et statistiques pour le développement des logiciels de traitements des données génomiques et post-génomiques

Mots-clés

Contenu

Présentation des approches pour l'alignement des séquences biologiques et de leurs applications
Présentation des bases de données génomiques
Présentation des méthodes de traitement des données génotypiques (SNP, CNV, indel,haplotypes, imputation,génotype, séquençage) et de leurs applications
Applications réalisées en TP de bioinfo avec notamment R et Bioconductor.

Modalité d'évaluation

Evaluation continue sur projet, travail bibliographique, oraux.

Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants

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Intitulé de la formation	Type	Modalité(s)	Lieu(x)
Intitulé de la formation Certificat de spécialisation Bio-informatique avancée	Type Certificat d'établissement	Lieu(x) À la carte	Lieu(x) Paris	Entrée Sans niveau spécifique
Intitulé de la formation	Type	Modalité(s)	Lieu(x)