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  • Bio-informatique

Outils mathématiques et informatiques pour la génomique

Mis à jour le

Responsable(s) : M. Josselin NOIREL, M. Jean-Francois ZAGURY

  • Cours
Code Cnam : BNF203-PAR
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  • Durée : 50 heures (+/- 10%)
  • A la carte
  • Soir & samedi
  • 6 crédits
  • Distanciel planifié

Présentation

Public, conditions d'accès et prérequis

Prérequis

UE d'informatique, de statistiques, et BNF104 du diplôme d'ingénieur de bio-informatique
Public de niveau Master

Objectifs

Connaitre les données, les outils algorithmiques et statistiques pour le développement des logiciels de traitements des données génomiques et post-génomiques

Informations pratiques

Contact

  • Département : Bioinformatique
  • Email : isabelle.corbeau@lecnam.net
  • Adresse : 17.0.16, 292 rue St Martin - 75003 Paris
Logo école santé Cnam
Logo Ecole numérique et IA Cnam

Programme

Contenu

Présentation des approches pour l'alignement des séquences biologiques et de leurs applications
Présentation des bases de données génomiques
Présentation des méthodes de traitement des données génotypiques (SNP, CNV, indel,haplotypes, imputation,génotype, séquençage) et de leurs applications

Applications réalisées en TP de bioinfo avec notamment R et Bioconductor.

 

Modalités d'évaluation

Evaluation continue sur projet, travail bibliographique, oraux.

Formation mère

Outils mathématiques et informatiques pour la génomique

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