Algorithmique de la bio-informatique
Code UE : BNF103
- Cours
- 6 crédits
Responsable national
Jean-Francois ZAGURY
Responsable opérationnel
Jean-Louis SPADONI
Public et conditions d'accès
Prérequis : Les auditeurs devront de préférence avoir assisté au cours BNF102 ou sinon justifier d'un niveau suffisant en programmation
Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2)
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent.
Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2)
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent.
Objectifs pédagogiques
Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bio-informatique.
Compétences visées
Cette formation doit permettre aux auditeurs non initiés de comprendre le fonctionnement des principaux programmes de la bio-informatique et pour pouvoir les utiliser au mieux.
Contenu
1) Bases algorithmiques
2) Alignements multiples et recherche de motifs
3) Recherche de similarités dans les banques : BLAST et FASTA
4) Assemblage de séquences et présentation de logiciels
5) Automates et expressions régulières
6) Recherche de gènes : méthodes heuristiques
2) Alignements multiples et recherche de motifs
3) Recherche de similarités dans les banques : BLAST et FASTA
4) Assemblage de séquences et présentation de logiciels
5) Automates et expressions régulières
6) Recherche de gènes : méthodes heuristiques
Modalité d'évaluation
Examen final
Bibliographie
- AD Baxevanis et al. Wiley Interscience New York (USA) : Bioinformatics
- L. Bloch Ed Technip : Initiation à la programmation avec Scheme
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RECHERCHE MULTI-CRITERES
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Type |
Intitulé |
Equipe pédagogique |
Modalité(s) / Lieu(x) |
Code |
|
---|---|---|---|---|---|
Type
Diplôme/ certificat
|
Equipe pédagogique
Industries, chimie, pharma et agroalimentaires
|
Modalité(s) / Lieu(x)
|
Code
LP10101A
|
||
Type
Diplôme/ certificat
|
Equipe pédagogique
Industries, chimie, pharma et agroalimentaires
|
Modalité(s) / Lieu(x)
|
Code
CC6500A
|
||
Type | Intitulé | Equipe pédagogique | Modalité(s) / Lieu(x) | Code |
Contact
Voir les dates et horaires, les lieux d'enseignement et les modes d'inscription sur les sites internet des centres régionaux qui proposent cette formation
UE
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Paris
-
Paris
- 2017-2018 2nd semestre : Présentiel
- 2018-2019 2nd semestre : Présentiel
- 2019-2020 2nd semestre : Présentiel
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Paris
-
Paris
Code UE : BNF103
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Responsable national
Jean-Francois ZAGURY
Responsable opérationnel
Jean-Louis SPADONI
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