Et le laboratoire MESuRS a aussi remporté un appel à projets ANRS flash contre le Covid-19!

Pour soutenir en urgence la recherche sur le COVID-19 dans les pays à ressources limitées, l’Agence nationale de recherche sur le VIH et les hépatites virales (ANRS) a lancé à un appel à projets exceptionnel COVID-19 Sud. Quatre millions d’euros seront disponibles pour des projets de recherche menés dans des pays à ressources limités. 

Ce projet, porté par Kévin Jean du laboratoire Modélisation, épidémiologie et surveillance des risques pour la sécurité sanitaire (MESuRS) du Cnam, a pour objectif d’étudier le risque associé à la transmission du SRAS-Cov-2 en contexte hospitalier et d’aider à son contrôle dans les établissements de soins égyptiens en s'appuyant sur un modèle mathématique pour simuler différentes stratégies d'organisation et de contrôle.

Le projet NOSOCOVID en détails

• Durée du projet : 15 mois
• Financement : 86 000€
• Mots-clés : modélisation mathématique, transmission, établissements de santé, stratégies de contrôle, soignant.e.s 

L'Egypte est le pays du continent africain qui a rapporté le premier cas confirmé de COVID-19 le 14 février 2020. La transmission locale a été confirmée depuis et, au 10 avril 2020, l'Égypte se classait parmi les pays africains les plus touchés avec 1 699 cas confirmés. La réponse des autorités sanitaires égyptiennes a été l’une des premières mises en place sur le continent. Actuellement, la prise en charge des malades repose sur plusieurs hôpitaux de quarantaine qui se consacrent uniquement aux patient.e.s atteint.e.s de COVID-19. Cette stratégie pourrait être complétée par une mobilisation plus large des hôpitaux généraux en cas de surcharge de patients COVID-19. 

Dans ce contexte, les établissements de santé sont confrontés à des défis majeurs. Tout d'abord, la propagation du SARS-Cov-2 en population générale entraîne une forte pression sur les lits d’hôpitaux disponibles et une saturation des hôpitaux dédiés aux patient.e.s COVID-19, notamment dans les unités de soins intensifs. Deuxièmement, l'épidémie, sa gestion et le fait que les soignant.e.s sont particulièrement exposés au virus provoquent une désorganisation à grande échelle de l'ensemble du système de santé. Troisièmement, il a été démontré que les établissements de santé sont des hauts lieux transmission du SARS-Cov-2, notamment en raison de la forte densité de contacts. 

Depuis le début de l’épidémie de COVID-19, les modèles épidémiologiques ont connu un vif intérêt. En représentant la propagation de pathogènes sous la forme d’équations mathématiques, ces modèles permettent à la fois de mieux comprendre les mécanismes de diffusion, mais aussi de simuler des interventions telles que le confinement à large échelle, afin d’en évaluer l‘impact. De tels modèles ont également permis de mieux comprendre la diffusion de pathogènes en milieu hospitalier, par exemple en estimant la contribution de différentes voies de transmission (via les contacts directs, ou via les objets ou surfaces souillés). Or, à l’heure actuelle, très peu de modèles ont été développés pour l’études de la diffusion de pathogènes en milieu hospitalier dans les pays du Sud. De plus, aucun modèle n’a été proposé pour étudier spécifiquement la diffusion du SRAS-Cov-2 (le virus responsable du COVID-19) dans les établissements de santé. 

L'objectif de ce projet est d’étudier le risque associé à la transmission du SRAS-Cov-2 en contexte hospitalier et d’aider à son contrôle dans les établissements de soins égyptiens. Plus précisément, le projet s'appuiera sur l'adaptation d'un modèle mathématique existant pour simuler différentes stratégies d'organisation et de contrôle en contexte hospitalier. Le modèle sera calibré afin de reproduire la circulation du SRAS-Cov-2 dans un hôpital de quarantaine égyptien (15th of May Hospital, Le Caire). Ensuite, seront évaluées différentes stratégies de contrôle, notamment celles envisagées par les autorités sanitaires locales, en termes de risque d'acquisition du COVID-19 par les soignant.e.s. Dans un deuxième temps, le modèle reproduira la circulation du SRAS-Cov-2 dans un hôpital général avec une section dédiée à la gestion du COVID-19, et les stratégies seront évaluées en termes de risque d'acquisition du COVID-19 par les patient.e.s et les soignant.e.s. 

Les résultats de ce projet permettront d’informer les stratégies de contrôle de la diffusion nosocomiale du SRAS-Cov-2 en Egypte. Plus largement, ces résultats pourront également être instructifs sur le continent africain et au-delà.